MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp28-4

Total Repeats: 992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017407	GTTTT	2	10	7	16	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017407	TA	3	6	178	183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017407	ATTT	2	8	218	225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017407	ATTTA	2	10	228	237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017407	GGA	2	6	238	243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017407	ATT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826818
7	NC_017407	TG	3	6	271	276	0 %	50 %	50 %	0 %	387826818
8	NC_017407	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	387826818
9	NC_017407	GAT	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
10	NC_017407	CTT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826818
11	NC_017407	AGA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
12	NC_017407	TTCT	2	8	559	566	0 %	75 %	0 %	25 %	387826818
13	NC_017407	GAA	2	6	633	638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
14	NC_017407	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
15	NC_017407	AGT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826818
16	NC_017407	A	6	6	808	813	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
17	NC_017407	TAA	2	6	815	820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
18	NC_017407	ATA	2	6	859	864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
19	NC_017407	GAA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
20	NC_017407	A	6	6	925	930	100 %	0 %	0 %	0 %	387826818
21	NC_017407	AC	3	6	933	938	50 %	0 %	0 %	50 %	387826818
22	NC_017407	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
23	NC_017407	TGG	2	6	1022	1027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387826818
24	NC_017407	AGA	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
25	NC_017407	AAG	2	6	1061	1066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
26	NC_017407	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
27	NC_017407	AAT	2	6	1203	1208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826818
28	NC_017407	GAA	2	6	1221	1226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826818
29	NC_017407	AT	3	6	1285	1290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017407	ATT	2	6	1354	1359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017407	TAG	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017407	CAT	2	6	1372	1377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017407	TAC	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017407	AAC	2	6	1479	1484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017407	ATT	2	6	1490	1495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017407	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
37	NC_017407	CTT	2	6	1561	1566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387826819
38	NC_017407	AT	3	6	1612	1617	50 %	50 %	0 %	0 %	387826819
39	NC_017407	TCAA	2	8	1641	1648	50 %	25 %	0 %	25 %	387826819
40	NC_017407	AAT	2	6	1649	1654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826819
41	NC_017407	ATT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826819
42	NC_017407	CTA	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826819
43	NC_017407	T	7	7	1717	1723	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
44	NC_017407	A	7	7	1783	1789	100 %	0 %	0 %	0 %	387826819
45	NC_017407	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	387826819
46	NC_017407	A	6	6	1862	1867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017407	AAT	2	6	1889	1894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017407	TAT	2	6	1916	1921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017407	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017407	ATT	2	6	1988	1993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017407	TTA	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017407	AAT	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017407	A	6	6	2061	2066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017407	TTA	2	6	2235	2240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826820
55	NC_017407	A	7	7	2264	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
56	NC_017407	AGA	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826820
57	NC_017407	TA	3	6	2306	2311	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
58	NC_017407	G	7	7	2333	2339	0 %	0 %	100 %	0 %	387826820
59	NC_017407	AATC	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	387826820
60	NC_017407	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
61	NC_017407	TC	3	6	2393	2398	0 %	50 %	0 %	50 %	387826820
62	NC_017407	AT	3	6	2422	2427	50 %	50 %	0 %	0 %	387826820
63	NC_017407	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
64	NC_017407	TAG	3	9	2461	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826820
65	NC_017407	TAC	2	6	2477	2482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826820
66	NC_017407	A	6	6	2538	2543	100 %	0 %	0 %	0 %	387826820
67	NC_017407	T	8	8	2584	2591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017407	TA	3	6	2598	2603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017407	A	8	8	2609	2616	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
70	NC_017407	A	7	7	2619	2625	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
71	NC_017407	A	6	6	2643	2648	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
72	NC_017407	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
73	NC_017407	AAC	2	6	2688	2693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
74	NC_017407	ATT	2	6	2748	2753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
75	NC_017407	AAT	2	6	2768	2773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
76	NC_017407	A	8	8	2781	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
77	NC_017407	A	6	6	2816	2821	100 %	0 %	0 %	0 %	387826821
78	NC_017407	CAA	2	6	2847	2852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
79	NC_017407	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
80	NC_017407	ATA	2	6	2891	2896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826821
81	NC_017407	AT	3	6	2923	2928	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
82	NC_017407	TAT	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826821
83	NC_017407	ATTA	2	8	2942	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	387826821
84	NC_017407	ACT	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
85	NC_017407	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826821
86	NC_017407	CTA	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826821
87	NC_017407	A	6	6	3054	3059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017407	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017407	TA	3	6	3116	3121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017407	A	8	8	3121	3128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017407	A	6	6	3130	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017407	GAA	2	6	3141	3146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017407	A	7	7	3167	3173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
94	NC_017407	TAA	2	6	3211	3216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
95	NC_017407	AC	3	6	3226	3231	50 %	0 %	0 %	50 %	387826822
96	NC_017407	ACA	2	6	3235	3240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
97	NC_017407	A	6	6	3254	3259	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
98	NC_017407	TAG	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387826822
99	NC_017407	ACA	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
100	NC_017407	TTA	2	6	3357	3362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826822
101	NC_017407	AAC	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826822
102	NC_017407	TAA	2	6	3407	3412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826822
103	NC_017407	A	7	7	3424	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	387826822
104	NC_017407	TAC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
105	NC_017407	CAAT	2	8	3451	3458	50 %	25 %	0 %	25 %	387826822
106	NC_017407	ACT	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387826822
107	NC_017407	TAT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017407	AAT	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017407	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	387826823
110	NC_017407	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	387826823
111	NC_017407	TTA	3	9	3798	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826823
112	NC_017407	TAA	2	6	3877	3882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017407	AAGAA	2	10	3883	3892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017407	TAAA	2	8	3913	3920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017407	TTA	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826824
116	NC_017407	ACA	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
117	NC_017407	AAC	2	6	4035	4040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
118	NC_017407	TAA	2	6	4055	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826824
119	NC_017407	CAA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387826824
120	NC_017407	AAACA	2	10	4106	4115	80 %	0 %	0 %	20 %	387826824
121	NC_017407	A	6	6	4132	4137	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
122	NC_017407	A	8	8	4166	4173	100 %	0 %	0 %	0 %	387826824
123	NC_017407	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017407	CTA	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017407	AGCC	2	8	4317	4324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017407	T	6	6	4459	4464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017407	ATC	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017407	TTTAAT	2	12	4511	4522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017407	A	6	6	4523	4528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017407	T	7	7	4593	4599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017407	ATA	2	6	4695	4700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017407	TA	4	8	4714	4721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017407	T	8	8	4729	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017407	ATT	2	6	4760	4765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017407	ACAA	2	8	4824	4831	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017407	ATT	2	6	4860	4865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017407	ATA	2	6	4886	4891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017407	TAA	2	6	4902	4907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017407	A	6	6	4906	4911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017407	T	8	8	4965	4972	0 %	100 %	0 %	0 %	387826825
141	NC_017407	AAAT	2	8	5008	5015	75 %	25 %	0 %	0 %	387826825
142	NC_017407	TAA	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387826825
143	NC_017407	AGA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387826825
144	NC_017407	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387826825
145	NC_017407	CAAAA	2	10	5097	5106	80 %	0 %	0 %	20 %	387826825
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